引言
患者陆某某，因“右肾结石8年”入住外院泌尿外科，拟行右肾结石手术治疗。入院查尿常规提示菌尿，涂片见大量革兰氏阴性杆菌，中段尿培养未获得明确病原学证据，考虑“复杂性尿路感染”。依据尿液涂片结果经验性抗感染治疗效果不佳，后转至我院，临床多项常规病原学检测均未获得明确病原学证据。将中段尿送检锐明微?后，检测结果及时帮助临床明确了感染病原菌，调整治疗方案后治疗有效，为后续进一步行手术治疗打下了基础。
一、病史
患者陆某某，女，55岁，因“右肾结石8年”于年8月11日入住我科。
1.现病史
患者8年前无明显诱因出现右侧腰痛，泌尿系B超提示“右肾结石”，尿常规提示尿路感染，予抗炎治疗后症状缓解，后未有腰痛发作，未特殊处理。
年8月患者因“子宫肌瘤”入院行手术治疗，期间复查泌尿系超声提示“右肾结石伴肾积水”，建议进一步治疗，遂于年7月20日就诊于外院泌尿外科，查尿白细胞计数.1/ul，腹部CT示“右肾结石，右肾积水，右侧输尿管稍扩张”，拟诊为“复杂性尿路感染”予“美罗培南1gq8h”治疗3天后，复查尿白细胞计数.2/ul，暂无手术条件，转至外院抗生素研究所进一步控制感染。
年7月30日查血常规示白细胞6.9*/l，中性粒细胞63.4%，CRP4.92mg/l，血沉46mm/h，尿白细胞计数.7/ul，多次尿涂片镜下见革兰氏阴性杆菌，尿培养阴性；住院期间予“哌拉西林-他唑巴坦4.5gq8h”治疗5天后，联合“阿米卡星40万单位qd”治疗3天，复查尿白细胞计数.6/ul；患者自动出院，现为进一步诊治收住我科。
2.既往史
高血压病病史8年余，平素服厄贝沙坦/氢氯噻嗪片，血压控制良好；
年8月，因“子宫肌瘤”行手术治疗；
年5月因“子宫出血”行诊断性刮宫术，术后病理未见明显异常；
年5月确诊“2型糖尿病”，现服阿卡波糖+二甲双胍治疗，血糖控制良好；
既往有高脂血症、高尿酸血症病史，未予重视。
3.个人史
出生于原籍，无外地久居史，无疫源区居住史，否认吸烟、饮酒等不良嗜好。
二、常规检查
查体：T：36.8℃，P：70次/分，R：16次/分，BP/56mmHg；神情，气平，皮肤巩膜无黄染，浅表淋巴结未及明显肿大，双肺呼吸音粗，未闻及明显干湿罗音，心律齐，心脏各瓣膜听诊区未闻及明显杂音，全腹软，无压痛、反跳，双肾区无叩痛，双下肢无水肿。
辅助检查
血常规：白细胞计数6.20x10^9/L，嗜中性粒细胞百分比57.1%，血红蛋白g/L，血小板计数x10^9/L；
C-反应蛋白5.03mg/L；
降钙素原0.04ng/ml；
红细胞沉降率32mm/h；
肾功能：尿素3.20mmol/L，肌酐50.0μmol/L，尿酸.00μmol/L，eGFR-EPICr；
尿常规：尿白细胞酯酶2+，尿沉渣红细胞计数51.2/μl，尿沉渣白细胞计数.8/μl，镜检白细胞52.2/HP，镜检红细胞9.2/HP；
尿液培养（鉴定+菌落计数）：2天未生长；
泌尿系统CTU：右侧肾盂、肾盏多发结石伴右肾积水；右侧肾盂输尿管移行处狭窄；
肾图+肾小球滤过率（GFR）显像：左肾GFR正常；右肾GFR轻度减低。
初步诊断：
复杂性尿路感染
右肾结石伴积水和感染
双肾囊肿
2型糖尿病
高血压病2级（高危）
三、治疗
患者入院当天留取中段尿送锐翌医学进行锐明微?病原微生物高通量测序，测序结果为：
屎肠球菌（Enterococcusfaecium）：该菌为革兰氏阳性球菌，呈单个、成对或短链状排列，无芽孢、无鞭毛，为需氧或兼性厌氧菌。它是人和动物肠道正常菌群组成的一部分，在机体免疫功能低下的情况下容易引发感染，可引起败血症、菌血症、血流感染、脑膜炎、心内膜炎、肺炎、蜂窝组织炎、肝脓肿、腹膜炎、角膜炎、眼内炎、尿路感染、骨髓炎、积脓症、脓肿等疾病。
依据测序结果调整抗感染方案：替考拉宁mgq12h静脉给药3次后续灌mgqd给药。
治疗1周后复查尿常规：尿沉渣红细胞计数9.5/μl，尿沉渣白细胞计数87.4/μl，镜检白细胞15.7/HP，镜检红细胞1.7/HP。
四、经验和体会
1.复杂性尿路感染是急诊内科常见的感染性疾病，它是指泌尿系统存在解剖或功能异常（如梗阻、结石等）或有肾外伴发病（如糖尿病），反复或持续发作的尿路感染，从而可导致肾功能严重受损；
大肠埃希菌是最常见的致病菌，其他尿路病原体包括其他肠杆菌科（如克雷伯菌属和变形杆菌属）、假单胞菌属、肠球菌和葡萄球菌（MSSA和MRSA）；
该患者外院多次尿液涂片均见革兰氏阴性杆菌，尿培养无阳性结果，经验性抗感染治疗效果不佳，患者转至我院后，结合其病史及已做病原学检测结果考虑致病菌耐药或经验性抗感染治疗未覆盖致病菌可能；
入院当天留取中段尿送锐翌医学进行锐明微?病原微生物高通量测序，次日检测结果回报提示屎肠球菌高序列数，依据测序结果调整抗感染治疗方案后患者菌尿好转，为后续进一步行手术治疗打下基础。
2.目前虽然有许多病原学检测方法，但仍有超过50%的感染性疾病不能确定相关病原体；
病原体高通量测序检测（mNGS）不基于培养，直接从临床样品中提取全部微生物的DNA/RNA，利用基因组学的研究策略研究样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能；
与传统的病原微生物检测技术相比，mNGS具有更高的敏感性，信息量大，可全面、快速、较为精准的查找病原微生物，指导临床抗感染方案的制定、调整及疗效评估。
锐明微?快速助力重症病患病原识别、快速检出，助力临床医生精准诊断，有效对症下药，帮助患者早日康复。
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